綜合司（移民事務國際合作司）

主要職責：負責機關文電、公務、機要、檔案、督查督辦、安全保密和信訪等工作。組織實施審計工作。承擔移民領域國際合作與交流。

政策法規司

主要職責：開展移民和出入境管理政策研究，起草相關法律法規草案。指導移民和出入境執法以及行政復議應訴、國家賠償、普法宣傳工作。

外國人管理司

主要職責：組織實施外國人來華口岸簽證簽發管理、簽證延期換發。組織實施外國人來華留學管理、停留居留管理、外國人來華工作有關管理事宜。承擔外國人來華定居審批管理工作。承擔難民身份甄別及臨時安置、遣返工作。承擔非法入境、非法居留、非法就業外國人治理和非法移民遣返的具體協調工作。

公民出入境管理司

主要職責：組織實施中國公民因私出入境管理、港澳臺居民回內地（大陸）定居審批管理工作。承擔國籍審批管理工作。

邊防檢查管理司

主要職責：組織實施出入境邊防檢查、邊民出入境檢查、臨時入境許可和邊境地區出入境通行證簽發管理。組織指導邊境地區邊防管理工作。組織實施邊控工作。

信息科技司

主要職責：擬訂全國移民管理機構信息化建設規劃、技術標準并組織實施。組織開展有關重大信息科技項目開發、推廣和安全運行管理。承擔政務信息化工作。

干部人事司

主要職責：指導管理所屬隊伍黨的建設、組織建設、思想政治工作。貫徹實施編制管理的方針政策，組織干部人事調配工作。組織實施表彰獎勵、新聞宣傳工作。組織開展隊伍教育訓練。組織實施督察工作。

后勤保障司

主要職責：負責局本級及所屬機構的預決算、財務管理、政府采購工作。組織實施有關基本建設、物資裝備、資產管理等工作。

機關黨委

主要職責：負責局機關和在京直屬單位的黨群工作。配合駐公安部紀檢監察組開展局本級及所屬機構的紀檢監察工作。

出入境管理信息技術研究所

主要職責：負責協助開展出入境管理科技發展戰略研究，開展信息網絡、證件、技術裝備等重點領域應用技術研究；承擔重大科技項目、業務核心軟件、關鍵技術裝備研發、建設任務，并開展相關咨詢工作；承擔國家移民和出入境管理相關信息、通信系統運行維護工作；管理電子出入境證件密鑰及關鍵設備；承擔移民和出入境技術、裝備、設施的安全質量監督、檢測工作；開展出入境證件司法鑒定及服務工作，為國家移民管理系統提供證件鑒別技術支持；承擔移民和出入境領域科技人才培養，承辦相關技術培訓和對外交流合作。

移民事務服務中心

主要職責：負責指導推動社會組織、基層組織和涉外企事業單位等開展來華移民定居人員語言、文化培訓輔導，促進移民社會融入；組織編印制作面向來華移民定居人員的法律、文化、社會、國情知識讀本和視聽資料，幫助熟悉適應工作、生活環境；開展國家移民管理政策法律宣傳咨詢，協助主管部門開展移民管理國際合作交流，服務引進外國人才和智力工作；收集分析國內外移民情況、特點、趨勢，提出移民管理政策法規修訂調整建議；了解掌握來華移民定居人員意見建議，協助相關主管部門改進服務管理工作；加掛“中國移民管理報社”牌子，編輯出版發行移民管理報紙、期刊，建設維護網絡媒體。

警務保障中心

主要職責：負責本級和機關委托管理的后勤保障、物業管理和生活服務等工作；承擔垂直管理機構來京公務人員的差旅服務協調保障；承擔機關委托管理的行政事務性工作；承擔機關保衛任務。